精灵的进化策略是提升队伍实力的核心。二周目相比一周目难度显著提升，对手的精灵等级更高且属性搭配更复杂，因此提前规划进化路线至关重要。火、水、电属性精灵是队伍的基础配置，混合属性精灵能有效应对多变的战斗环境。通过野外战斗或道馆挑战积累经验值是快速进化的主要途径，但需注意野外精灵等级普遍低于道馆，适合作为过渡期的练级选择。
进化过程中需合理利用道具加速成长。太阳之石、月之石等进化石可直接触发特定精灵的进化，而学习装置能让未出战精灵共享经验值。携带幸运蛋的精灵可获得额外50%经验值加成，大幅缩短进化所需时间。战斗中需注意保存药品如PP恢复剂和状态恢复道具，避免因战斗中断影响进化节奏。二周目新增的隐藏区域往往栖息着高种族值精灵，捕捉后可直接投入战斗或作为进化素材。
通讯进化是二周目的特殊机制，需要与其他玩家联机交换精灵才能完成。鬼斯通、豪力等精灵必须通过通讯进化才能获得最终形态，建议提前规划通讯对象。部分精灵需学会特定技能后才能进化，例如伊布需使用水之石、雷之石或火之石分支进化。游戏后期获得的秘传机如冲浪、飞行等技能，不仅能解锁新区域，也是某些精灵进化的前置条件。
二周目剧情推进会解锁神兽捕捉机会，超梦、急冻鸟等传说精灵的加入能显著提升队伍上限。这些精灵通常无需复杂进化流程，但捕捉难度较高，建议准备足够的高级球和状态异常道具。完成支线任务如恢复正辉的电脑、解决火箭队事件后，可获得稀有进化道具或直接获得已进化精灵。二周目结束时，一支全进化形态的队伍是挑战四天王与冠军的必要条件。
进化后的精灵需通过属性克制测试才能发挥最大战力。电系克制水系、草系克制地面系等基础规则在二周目依然适用，但对手会针对弱点携带反制技能。建议在进化后保留至少两种不同属性的攻击技能，以应对属性联防。精灵中心的回忆技能功能可找回进化前学会的强力技能，合理利用能弥补进化后的技能缺口。
